قهوه بدون کافئین هم مانند قهوه معمولی از دانه‌های قهوه درست می‌شود. اما بیشتر کافئین آن پیش از رست کردن و آسیاب شدن گرفته می‌شود. اغلب در مراحل کافئین زدایی، دانه‌های قهوه را در حلال‌های آلی مانند آب خیس می‌کنند تا از این طریق کافئین قهوه را به خود جذب کند.