سوراخی‌های معده و اثنی‌عشر و نشت آن، همچنین عوارض عفونی از دیگر عوارض جراحی بوتاکس معده است و در جراحی چاقی کوتاه مدت و درازمدت سودبخش نیست. از نظر انجمن چاقی و فدراسیون هم این عمل مورد تایید نیست.